L’ECC Sud-Kivu entretient des relations étroites avec diverses organisations aussi bien au niveau international que national. Tout d’abord, des organisations internationales qui, grâce aux appuis financiers accordés aux départements et services (Réseau d’Innovation organisationnelle, Coordination provinciale des écoles conventionnées protestantes, Coordination des œuvres médicales, Commission Justice , Paix et Sauvegarde de la Création-Programme d’Éducation à la démocratie, Fédération des Femmes Protestantes, Fédération des Laïcs protestants, Fédération des Jeunes pour Christ), soutiennent diverses activités dans le domaine de l’enseignement, de la santé, de l’évangélisation et du social.
Ces différents partenariats et collaborations contribuent à assurer la visibilité de l’Église, à encourager ses membres à rendre témoignage de leur foi en Christ. Schématiquement, le réseau des partenaires se présente dans le tableau qui précède.